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5个宽体金线蛭种群遗传多样性和遗传分化的SNP分析

文献类型: 中文期刊

作者: 高凯利 1 ; 马学艳 2 ; 王海华 3 ; 李涵 3 ; 李燕华 3 ; 金武 1 ; 闻海波 1 ;

作者机构: 1.南京农业大学无锡渔业学院

2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业农村部稻渔综合种养生态重点实验室

3.江西省水产科学研究所/南昌市特种水产繁育与健康养殖重点实验室

关键词: 宽体金线蛭;单核苷酸多态性;遗传分化;遗传多样性;群体结构;群体遗传学;遗传育种;系统发育树

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2024 年 40 卷 029 期

页码: 144-149

收录情况: CSCD

摘要: 为了解宽体金线蛭(Whitmania pigra)群体的遗传特征,本研究使用单核苷酸多态性标记法对5个地点的宽体金钱蛭(W. pigra)群体(江西抚州AH、安徽太和TH、江西南昌JX、山东微山WSH、山东济南JN)进行遗传多样性和群体遗传结构分析。种群结构分析和主成分分析表明5个宽体金钱蛭种群可追溯至3个不同的种群来源。系统发育树分析结果显示AH种群与TH种群存在部分分支交叉,JX种群、WSH种群和JN种群单独成支。5个群体的成对FST值在0.03~0.20之间,群体两两之间遗传距离在0.03~0.22之间,单核苷酸多态性(π)为0.003974~0.004131,群体间遗传分化程度较低,多态性信息含量(PIC)的含量在0.16~0.20,观测杂合度(Ho)含量在0.18~0.27,近交系数(F)的含量值为-0.07912~0.09063,宽体金钱蛭5个群体有比较低的遗传多样性。Tajima's D值均值为正值,即群体处于稳定状态。群体间遗传变异主要来自群体内部,群体间具有较低的遗传多样性,推测可能是宽体金线蛭在养殖过程中进行了频繁的苗种移养或亲本引种。

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