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牙鲆微卫星标记的开发及多态性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张潇峮 1 ; 徐亘博 2 ; 廖小林 2 ; 张家波 1 ; 陈松林 2 ;

作者机构： 1.华中农业大学水产学院

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 牙鲆;微卫星;FIASCO;多态性

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2011 年 35 卷 07 期

页码： 4-11

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 将牙鲆基因组DNA经限制性内切酶RsaⅠ和Bst UI双酶切后采用FIASCO法构建酶切片段基因组文库。共挑取269个克隆,177个为阳性克隆,阳性克隆率为65.79%。经测序后获得191条微卫星序列,其中完美型占74.35%;非完美型占14.66%;混合型占10.99%。用引物设计软件Primer Premier 5.0设计引物153对,挑选其中的50对合成并在32个野生牙鲆个体中进行扩增,共31个位点具有多态性,统计结果后使用POPGENE软件进行分析,平均等位基因个数为3.939 4,平均有效等位基因数为3.052 2,平均观测杂合度为0.650 1,平均期望杂合度为0.586 6,各引物的Hardy-Weinberg平衡指数在0.012 587～0.984 917变动。这些筛选出的多态性微卫星标记可应用于进一步的牙鲆遗传多样性分析、家系分析及遗传图谱的构建等工作中。

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[2]牙鲆骨骼生长性状与微卫星标记的相关性分析. 安泉泉,刘海金,王桂兴,刘永新,刘奕. 2012

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[5]牙鲆渤海自然群体的遗传多样性分析. 刘永新,朱以美,刘英杰,高磊,方辉,韩刚,王玉芬,姜秀凤,刘海金. 2013

[6]牙鲆卵裂雌核发育纯系的建立及鉴定. 齐文山,田永胜,姜静,王磊,张文婷,陈红林,张英平,刘万军,孙德强. 2014

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[8]基于M-C作图鉴定牙鲆不同二倍体的遗传特征. 韩慧宗,蒋丽,刘奕,王桂兴,刘海金,刘永新,刘英杰. 2013

[9]牙鲆微卫星分子标记与生长性状的相关性分析. 王桂兴,刘永新,孙效文,刘海金. 2009

[10]有丝分裂雌核发育牙鲆的微卫星鉴定. 刘海金,陆桂,王晓梅,刘永新,王玉芬,王桂兴. 2010

[11]牙鲆连续四代减数分裂雌核发育家系的遗传特征分析. 王桂兴,张晓彦,孙朝徽,赵雅贤,都威,侯吉伦,王玉芬. 2019

[12]基于双单倍体牙鲆挖掘与生长性状连锁的微卫星标记. 刘永新,王桂兴,王玉芬,司飞,孙朝徽,张晓彦,刘海金. 2011

[13]mtDNA和微卫星标记在放流牙鲆和非放流牙鲆鉴定中的应用. 童爱萍,司飞,刘海金,王桂兴,于清海,王玉芬,姜秀凤,侯吉伦. 2015

[14]牙鲆减数分裂与有丝分裂雌核发育的遗传差异. 刘海金,刘永新,王玉芬,侯吉伦,王桂兴,孙朝徽,张晓彦. 2010

[15]牙鲆微卫星标记遗传连锁图谱的构建. 宋文涛,张潇峮,廖小林,邵长伟,王磊,庞仁谊,牛余泽,赵永伟,李文龙,梁卓,田永胜,陈松林. 2011

[16]牙鲆遗传作图及生长性状QTL定位. 牛余泽,廖小林,宋文涛,王磊,赵永伟,高峰涛,陈松林. 2012

[17]牙鲆有丝分裂雌核发育二倍体的遗传特性分析. 许丹丹,刘永新,王桂兴,刘奕,王玉芬,刘海金. 2013

[18]牙鲆亲本间遗传距离与其后代生长速度的相关性分析. 毕金贞,陈松林. 2010

[19]牙鲆微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析. 王蕾,张立冬,万玉美,谭照君,孙效文. 2010

[20]野生抗病牙鲆MHC II B内含子1和外显子2序列多态性. 徐建勇,陈松林,毕金贞. 2008

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