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碱胁迫条件下玉米苗期根部转录组表达谱分析

文献类型: 中文期刊

作者: 董菁 1 ; 张春宵 1 ; 刘学岩 1 ; 金峰学 1 ; 刘文平 1 ; 吴委林 2 ; 李晓辉 1 ;

作者机构: 1.吉林省农业科学院(中国农业科技东北创新中心)玉米研究所

2.延边大学农学院

关键词: 玉米;苗期;耐碱;转录组;基因挖掘

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2025 年 23 卷 019 期

页码: 6337-6349

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以耐碱自交系‘郑58’和碱敏感自交系‘昌7-2’为材料,分析供试材料在100 mmol/L Na2CO3溶液胁迫下0和5 h的转录组数据。与对照0 h相比较,在‘郑58’和‘昌7-2’分别鉴定出4 389和3 971个上调、3 416和3 024个下调差异基因。对抗感材料间共同上调和‘郑58’特有上调DEGs进行GO富集、REVIGO分析和KEGG富集以及重点通路分析结果表明:‘郑58’和‘昌7-2’间共同上调DEGs显著富集的条目包括对化学物质的反应、压力反应的调节和苯丙烷代谢过程等相关GO条目,‘郑58’特有上调显著富集在对内源性刺激的反应、苯丙酸生物合成过程和氨基酸转运等GO条目。共同上调DEGs在苯丙烷生物合成、植物MAPK信号等12个通路上显著富集,‘郑58’特有上调DEGs在糖酵解/糖异生、植物激素信号转导和苯丙烷生物合成等10个通路上显著富集。耐性材料‘郑58’上调的转录因子在NAC和MYB转录因子家族分布数量较多。与植物激素信号转导、苯丙烷生物合成通路相关的基因,MYB和NAC转录因子家族基因可能与玉米耐碱性密切相关。研究结果为玉米耐碱机理提供了相关数据支撑,也能够为将来培育耐碱品种提供理论及优质材料基础。

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