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大菱鲆脾脏cDNA文库构建、EST序列分析与免疫抗病相关基因的筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 孟亮 1 ; 陈松林 2 ; 刘洋 2 ;

作者机构： 1.中国海洋大学海洋生命学院

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室

关键词： 大菱鲆;cDNA文库;表达序列标签;免疫相关基因

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2009 年 33 卷 05 期

页码： 3-8

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以大菱鲆脾脏为材料,构建cDNA文库,通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析,共获得3 656个大菱鲆脾脏表达序列标签(EST)。经与GenBank数据库的序列比对后发现,1 891个EST代表了149个已知基因,其余1 765个EST为未知序列。这149个基因大致可分为6类:9个为细胞结构类(6.0%);26个为代谢类(17.5%);45个为细胞防御/免疫类(30.2%);43个为基因/蛋白质表达类(28.9%);16个为细胞信号转导/细胞交流类(10.7%);10个无法明确分类(6.7%)。鉴定的与免疫抗病相关重要基因主要有:CC/CXC趋化因子;主要组织相容性复合体(MHC)class I;αC3补体;天然杀伤细胞增强因子(NKEF);胸腺素β-4/β-12;干扰素诱导蛋白G ig1;白介素8受体;STAT4;热激蛋白70/90等。

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