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象耳豆根结线虫actin基因的克隆与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 练冬梅 1 ; 赵志祥 2 ; 陈绵才 2 ; 王会芳 2 ;

作者机构: 1.海南大学环境与植物保护学院

2.海南省农科院农业环境与植物保护研究所

关键词: 象耳豆根结线虫;Actin基因;全长cDNA

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2014 年 27 卷 03 期

页码: 1091-1095

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用RT-PCR、cDNA末端快速扩增法(RACE),克隆了象耳豆根结线虫生长发育关键基因actin的全长cDNA序列(登录号:KF534787),并与NCBI核酸数据库进行序列比对,结果表明:序列全长1298 bp,包含一个全长1125 bp的开放阅读框ORF,编码375个氨基酸,起始密码子在82位,终止密码子在1207位,与已知的其它物种的actin具有高度的保守性,与马铃薯腐败线虫和松才线虫actin的同源性分别为99.20%和98.67%,与秀丽隐杆线虫、人类相似性分别达到98.67%和97.33%。系统发育分析表明,象耳豆根结线虫actin可能是β-actin,同时也发现了象耳豆根结线虫actin与人类的胞质actin(β-actin)更相似。本研究填补了GenBank数据库中象耳豆根结线虫内标参照基因的空白。

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