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玉米ZmRab6A基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 时丕彪 1 ; 胡凤琴 2 ; 顾小兵 1 ; 吕远大 3 ;

作者机构： 1.盐城市新洋农业试验站

2.中国科学院南京土壤研究所

3.江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所

关键词： 玉米;ZmRab6A;基因;克隆;生物信息学

期刊名称： 大麦与谷类科学

ISSN： 1673-6486

年卷期： 2020 年 006 期

页码： 14-20

摘要： 为研究小分子量三磷酸鸟苷（guanosine triphosphate, GTP）结合蛋白的分子功能,利用RT-PCR技术克隆玉米Rab6A基因的c DNA全长序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,该基因c DNA全长1 044 bp,包含1个660 bp的开放阅读框,编码219个氨基酸。ZmRab6A基因含有6个外显子和5个内含子,全长2 650 bp。ZmRab6A蛋白的分子量为24.39 ku,理论等电点为5.58,属于亲水性不稳定蛋白,不存在跨膜区域和信号肽,二级结构多为无规卷曲和α-螺旋。系统进化分析表明,玉米ZmRab6A与高粱的亲缘关系最近。

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