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基于Roche 454 GS FLX的钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae)微卫星标记的开发

文献类型： 中文期刊

作者： 潘婷 1 ; 张岩 2 ; 张辉 3 ; 高天翔 4 ; 肖永双 3 ; 姜云荣 1 ;

作者机构： 1.上海海洋大学水产与生命学院

2.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所

3.中国科学院海洋研究所

4.中国海洋大学水产学院

关键词： Roche 454 GS FLX;钝吻黄盖鲽;开发;微卫星标记

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 1000-7075

年卷期： 2015 年 36 卷 01 期

页码： 26-32

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用Roche 454 GS FLX平台测序技术进行了钝吻黄盖鲽微卫星引物筛选,并采用聚类分析的方法对得到的5641个微卫星位点进行类比分析,得到247种多态性位点,其中完美型占52.22%,非完美型占20.24%,复合型占27.54%,(AC)n、(AG)n两碱基重复类型的比例是44%,重复次数在10次以上的占总数的87.5%。随机选取11个位点的微卫星引物,采用5个野生个体,利用荧光标记和毛细管电泳进行多样性评价,4个位点偏离Hardy-Weinberg平衡,不同位点得到的等位基因范围为3-8,平均等位基因数为5.0。平均观望杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)及平均多态性信息含量(PIC)分别为0.588、0.788和0.670。结果表明,454 GS FLX提供了一种直观、高效开发微卫星的方法。

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