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珠母贝属6个种的ITS 2分子标记研究

文献类型： 中文期刊

作者： 喻达辉 1 ; 朱嘉濠 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院南海水产研究所

2.香港中文大学李福善海洋科学研究中心

关键词： 种类鉴定;基因型;序列变异;核糖体DNA

期刊名称： 南方水产

ISSN：

年卷期： 2005 年 1 卷 04 期

页码： 10-16

摘要： 对珠母贝属的大珠母贝、珠母贝、白珠母贝、黑珠母贝、长耳珠母贝、黑珠母贝和合浦珠母贝6个种的内部转录间隔区2(ITS2)序列及其两侧的5.8S和28S的部分序列进行了比较分析。其中黑珠母贝的序列来自GenBank。PCR扩增片段大小为600bp左右,测序结果表明,ITS2长211～254bp,两端的5.8S和28S分别长84bp和272bp(均含引物)。序列比对分析结果表明,5.8S和28S序列高度保守,不适合于种类鉴定,而ITS2序列高度变异,270个比对位点中有146个位点发生突变,其中72个位点发生插入/缺失突变。除白珠母贝和黑珠母贝之间的遗传距离较小外,其余种类之间的遗传距离远远大于种内遗传距离。基因型分析表明,每个种具有各自特有的基因型。基因型和序列变异分析表明ITS2序列可作为珍珠贝种类鉴定的分子标记。可用于种间、杂交育种、幼体和珍珠贝肉等材料的种类鉴定与遗传分析。

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