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甜瓜果肉硬度KASP标记的开发与应用

文献类型: 中文期刊

作者: 李肯 1 ; 张伟 1 ; 武云鹏 1 ; 彭冬秀 2 ; 张若纬 2 ;

作者机构: 1.天津科润农业科技股份有限公司蔬菜研究所

2.蔬菜生物育种全国重点实验室

关键词: 甜瓜;果肉硬度;基因定位;KASP标记;辅助选择育种

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2024 年 51 卷 004 期

页码: 773-786

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为提高不同果肉硬度类型甜瓜材料的选择效率,以脆肉甜瓜自交系20S11和软肉甜瓜自交系20S75为亲本,构建F2与BCiF1群体,分析了果肉硬度性状的遗传规律为单基因遗传,脆肉相对于软肉为显性.根据F2分离群体构建果肉硬度极端性状混池,利用全基因组重测序结合图位克隆技术,将果肉硬度基因CmPfl定位在10号染色体上约54.71 kb的区域内.通过重测序分析发现,软肉甜瓜20S75中编码 GATL3(galacturonosyltransferase-like 3)的基因 MELO3C012216(CmGATL3)存在 1 处终止密码突变,位于编码区第567位碱基处(C-G),导致蛋白翻译提前终止,造成转移酶蛋白结构域完全缺失.利用qRT-PCR对CmGATL3进行表达模式分析,结果显示其在脆肉甜瓜20S11中的表达量显著高于软肉甜瓜20S75.基于上述变异位点,开发PF-KASP分子标记并对56份甜瓜自交系材料进行基因型检测,其中脆肉材料均表现为C∶C型,软肉材料均表现为G∶G型,标记呈共显性.进一步利用PF-KASP对F2群体进行基因型鉴定,与果肉硬度表型鉴定结果相比较,准确率达到100%.

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