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腐烂茎线虫rDNA-ITS序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘先宝 1 ; 谭志琼 2 ; 葛建军 3 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所、海南省热带农业有害生物检测监控重点实验室

2.海南大学环境与植物保护学院

3.中国检验检疫科学院动植物检疫研究所

关键词： 腐烂茎线虫;rDNA-ITS;序列分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2008 年 29 卷 03 期

页码： 385-389

收录情况： CSCD

摘要： 利用一对通用引物rDNA1/rDNA2扩增6个腐烂茎线虫供试群体的rDNA-ITS区域,获得序列长度不等的片段。Des-1、Des-2和Des-3群体扩增片断长度均为1130bp。而Des-5、Des-6和Des-7群体的扩增片段长度均为942bp,与以上群体相比,在ITS区具有一个188bp的缺失片段。序列比对后确定缺失片段位于ITS1区,而且该片段含有多个可重复小片段,这可能是造成碱基缺失的原因。根据遗传进化分析可将供试线虫分为两个大的群体。

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