文献类型： 中文期刊

作者： 孙玥 ¹ ; 杨秀荣 ² ; 郭彦丽 ¹ ; 李军玲 ¹ ; 李月娇 ² ; 孙淑琴 ² ; 路信 ¹ ; 刘燕清 ¹ ; 佟卉 ¹ ; 孙林静 ¹ ; 刘静妍 ¹ ; 张融雪 ¹ ; 王晓静 ¹ ; 苏京平 ¹ ; 王胜军 ¹ ; 赵习朴 ¹ ; 闫双勇 ¹ ;

作者机构： 1.天津市农业科学院农作物研究所/天津市农作物遗传育种重点实验室

2.天津市农业科学院植物保护研究所

关键词： 水稻;分子标记开发;高通量测序;QTL定位(QTL-seq);InDel标记;多态频率

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2022 年 50 卷 001 期

页码： 34-39

收录情况： 北大核心

摘要： 基于极端表型单株高通量测序的定位方法QTL-seq已成为植物QTL分析的一种主要方法.继QTL-seq分析后,对目标QTL定位区间进行分子标记开发时,由于目标区间大,所含变异位点多,特定区间的分子标记开发仍是一件较繁琐的事.为提高特定区间分子标记开发的效率,本研究建立了基于高通量测序数据基础的特定脚本程序,可简单快速地完成水稻基因组任意区间的InDel标记开发.本研究开发了来自7个不同作图群体和染色体区间的有8 bp以上片段长度差异的InDel标记708个,平均每17.6 kb有1个InDel标记;对95个标记进行试验验证,总体多态频率为63%.本研究建立的方法在水稻及其他已测序的植物重要农艺性状控制QTL的分子标记辅助育种、精细定位和图位克隆中有重要应用价值.