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均匀设计与正交设计优化海岛棉RGA-PCR体系

文献类型: 中文期刊

作者: 李吉琴 1 ; 孔庆平 2 ; 陈全家 1 ; 赵其波 2 ; 孔杰 2 ; 宁新民 2 ; 梁亚军 1 ; 曲延英 1 ;

作者机构: 1.新疆农业大学农学院

2.新疆农科院经作所

关键词: 均匀设计;正交设计;海岛棉;RGA-PCR;体系优化

期刊名称: 新疆农业科学

ISSN: 1001-4330

年卷期: 2009 年 46 卷 05 期

页码: 929-934

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用均匀设计和正交设计对影响海岛棉RGA体系Mg~(2+)、dNTP、引物以及Taq DNA聚合酶浓度等因素进行了均匀优化和正交优化试验后建立了适合于海岛棉RGA的反应体系:在10μL反应体系中1×Buffer,Mg~(2+)2.5 mmol/L,dNTP 0.25 mmol/L,引物浓度1.0μmmol/L,Taq酶0.375 U/μL,DNA 20 ng。各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以Mg~(2+)浓度影响最大,Taq DNA聚合酶的影响最小。运用该体系对海岛棉材料进行验证,证明该体系稳定可靠,并从22对RGA引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的10对引物。这一体系的建立及多态性引物的筛选为今后利用RGA标记技术进行海岛棉枯萎病研究提供了科学依据。

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