文献类型： 中文期刊
作者： 张梅 1 ; 米铁柱 2 ; 甄毓 2 ; 王华龙 3 ;
作者机构： 1.中国海洋大学环境科学与工程学院;海洋环境与生态教育部重点实验室;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室;中国海洋大学海洋生命学院
2.;中国海洋大学环境科学与工程学院;海洋环境与生态教育部重点实验室;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室;中国海洋大学海洋生命学院
3.;中国海洋大学环境科学与工程学院;海洋环境与生态教育部重点实验室;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室;中国海洋大学海洋生命学院;
关键词： 玛氏骨条藻;脂肪酸合成;转录组
期刊名称： 中国海洋大学学报(自然科学版)
ISSN： 1672-5174
年卷期： 2018 年 04 期
页码： 81-93
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 本研究利用Illumina Hiseq2000对不同生长时期的玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)进行转录组测序,得到的转录本通过NR、NT、Swiss-Prot和KOG数据库进行功能分类,通过GO和KEGG数据库进行相关代谢途径分析和基因差异表达分析,在此基础上构建了S.marinoi的脂肪酸生物合成途径,发现共存在26种酶和蛋白对应的33个编码基因,对这33个基因序列进行比对发现其与假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)的同源性较高。在该代谢通路中,S.marinoi在不同生长时期出现显著差异表达的基因有15个。与指数期相比,柠檬酸裂解酶和长链酰基-CoA合成酶(Comp14198_c0)的编码基因在稳定期和衰亡期出现显著下调表达,而柠檬酸合酶的编码基因仅在稳定期出现显著下调表达。与之相反的是,以乙酰-CoA羧化酶编码基因为代表的12个编码基因在稳定期和衰亡期均出现了显著上调。通过分析,初步推测S.marinoi在稳定期的脂肪酸合成能力高于指数期。这些信息为海洋微藻脂肪酸生物合成途径的研究提供了理论基础,有助于对S.marinoi进行基因改造,提高脂肪酸的合成量。同时,又能为赤潮的防治提供新的思路。
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