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长穗偃麦草EeSKOR基因片段的克隆、表达及其生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周妍彤 1 ; 郭强 2 ; 毛培春 2 ; 田小霞 2 ; 崔国文 3 ; 孟林 2 ;

作者机构: 1.北京市农林科学院北京草业与环境研究发展中心

2.北京草业与环境研究发展中心

3.东北农业大学动物科学技术学院

关键词: 长穗偃麦草(Elytrigia elongata);EeSKOR;生物信息学分析;盐胁迫

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN:

年卷期: 2020 年 010 期

页码: 4686-4694

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 外整流钾离子转运蛋白(SKOR)在植物细胞抵御盐胁迫、保持胞内钾稳态过程中发挥重要作用。本研究采用RT-PCR结合RACE技术提取长穗偃麦草RNA,设计引物对长穗偃麦草EeSKOR基因的生物信息学及其表达模式进行了分析。结果表明,EeSKOR核心片段为555 bp核心氨基酸与小麦SKOR核心氨基酸同源性高达90%以上。EeSKOR片段全长cDNA为2 402 bp,编码717个氨基酸,包含2 154 bp的开放阅读框(ORF),78 bp的5’非编码区(UTR)和170 bp的3’非编码区(UTR)。所得序列与其他植物氨基酸序列同源性均在80%以上,与小麦TaSKOR氨基酸同源性高达87.67%。EeSKOR含有SKOR类蛋白的P环结构具丝氨酸位点,并随NaCl处理浓度的增加,与对照相比,长穗偃麦草植株叶鞘和叶片中EeSKOR基因表达水平呈下降趋势,总体表现为根>叶片>叶鞘的变化趋势,说明长穗偃麦草EeSKOR基因的表达受到盐胁迫诱导和调节。

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