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灰斑古毒蛾核型多角病毒EcoR I-O片段的克隆与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨丽荣 1 ; 闫海霞 1 ; 全鑫 1 ; 薛保国 1 ; 达楞巴雅尔 2 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院

2.内蒙古自治区乌审旗林业局

关键词: 灰斑古毒蛾核型多角体病毒;EcoRI-O片段;egt基因;Ol-129同源基因

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2010 年 25 卷 01 期

页码: 59-64

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 分析了灰斑古毒蛾核型多角体病毒(Orgyia ericaenucleopolyhedrovirus,OrerNPV)EcoR I-O片段分子生物学特征,为研究egt基因分子特性和杆状病毒遗传改良提供科学依据。克隆和分析了OrerNPVEcoR I-O片段所包含的2个基因,并应用生物软件对OrerNPV蜕皮甾体尿苷二磷酸葡糖转移酶(egt)基因及其启动子进行了比对分析。结果表明OrerNPVEcoR I-O片段包含egt基因和Ol-129同源基因,在该区域中编码egt基因的开放阅读框(ORF)由1 539个核苷酸组成,可以编码512个氨基酸,预计蛋白质分子质量为57.9 kDa。OrerNPV和NPVs之间的同源性为46%~89%,与白斑天幕毛虫核型多角体病毒(Orgyia leucostigmaNPV,OlNPV)egt基因同源性最高,达89%,与棉褐带卷叶蛾核型多角体病毒(Adoxophyes oranaNPV,AoNPV)同源性最低为46%;而OrerNPV和GVs之间的同源性为44%~55%,小于与NPVs之间的同源性;与昆虫UGT间同源性最低,与家蚕UGT间同源性为41%。EcoR I-O片段+M13端含有编码OlNPV ORF129(Ol-129)Ol-129同源基因ORF,由597 bp个核苷酸组成,在其起始密码子ATG上游-64,-24 nt处各有1个TATA box,其推测的氨基酸序列与Ol-129同源性最高达81%,与LdNPV ORF127同源性最低,为40%。明确了OrerNPVEcoR I-O片段的序列特征,以及OrerNPVegt基因特性。

  • 相关文献

[1]灰斑古毒蛾核型多角体病毒EcoRⅠ-U片段的克隆与序列分析. 杨丽荣,薛保国,刘红彦,王正军,王秀美. 2009

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