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芸苔链格孢菌与白菜互作基因表达谱芯片分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘影 1 ; 徐文静 1 ; 杜茜 1 ; 杨信东 2 ; 李启云 1 ;

作者机构: 1.吉林省农业科学院

2.吉林农业大学

关键词: 白菜黑斑病;基因芯片;差异表达

期刊名称: 北方园艺

ISSN: 1001-0009

年卷期: 2010 年 07 期

页码: 116-118

收录情况: 北大核心

摘要: 利用拟南芥基因芯片,对白菜经芸薹链格孢菌侵染前后的基因表达谱进行比较分析。结果表明:差异表达基因385个,其中上调基因为280个,下调基因为105个。将所筛选出的差异表达基因分为14类,即:病程相关基因,防御相关基因,氧爆作用类,信号转导类,激素相关类,运输类,非生物胁迫类,细胞维持与发育,细胞壁修饰类,次生代谢类,代谢与合成类,蛋白降解类,及假想蛋白和未知功能蛋白。生物信息学分析显示,检测到的信号转导类基因差异表达比例最高,占24%;其次,防御基因和代谢合成基因占的比例也较高,分别达到13%和14%。值得注意的是,直接与病程发生相关差异表达的基因很少。同时,在差异表达基因中,未知蛋白和假想蛋白占有很大比例。

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