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中华虎头蟹线粒体16S rRNA和COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘萍 1 ; 段亚飞 2 ; 毛智超 2 ; 李吉涛 2 ; 高保全 2 ; 李健 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室

关键词： 中华虎头蟹;线粒体DNA;16S rRNA基因;COⅠ基因;序列分析

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2013 年 37 卷 10 期

页码： 1441-1451

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究中华虎头蟹野生群体的种质资源及遗传多样性状况,采用PCR扩增获得中华虎头蟹线粒体DNA的16S rRNA和COⅠ基因片段,分别对其进行序列比较及系统进化分析。16S rRNA和COⅠ基因片段的A+T平均含量分别为67.7%和61.4%,A+T含量显著高于G+C含量。长度为515 bp的16S rRNA基因片段共检测出单倍型4种,多态性位点4个,均为单一变异位点;长度为653 bp的COⅠ基因片段共检测出单倍型11种,多态性位点23个,其中简约信息位点5个和单一变异位点18个。COⅠ基因片段比16S rRNA基因片段具有较大的变异,更适于中华虎头蟹种群的遗传多样性分析。基于16S rRNA和COⅠ基因片段的遗传距离与系统进化分析结果一致,表明中华虎头蟹与梭子蟹科的蟹类亲缘关系最近,方蟹科与沙蟹科的蟹类聚为一支,与传统分类结果基本一致;而脊椎动物2个基因片段的系统进化分析结果不一致。根据16S rRNA基因片段的遗传距离推测出4科7种蟹的大致分化时间发生在古新世至始新世。

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