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基于线粒体细胞色素b基因片段序列变异探讨3种鲳属鱼类系统进化

文献类型： 中文期刊

作者： 马春艳 1 ; 赵峰 2 ; 孟彦羽 2 ; 施兆鸿 2 ; 庄平 2 ; 赵云龙 1 ;

作者机构： 1.华东师范大学生命科学学院

2.中国水产科学研究院东海水产研究所

关键词： 线粒体DNA;细胞色素b;鲳属;系统进化

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 1000-7075

年卷期： 2009 年 30 卷 05 期

页码： 20-26

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对鲳属3种鱼类共19个个体的细胞色素b(Cytb)基因进行PCR扩增,经比对校正得到1123bp的基因片段,共检测到141个变异位点,总变异为12.56%,5个简约信息位点,未出现插入和(或)缺失,序列中转换(Transition)明显多于颠换(Transversion)。鲳属3种鱼类19个序列共检测到11种单倍型,其T、C、A和G平均含量分别为29.1%、30.5%、27.4%和13.0%。(A+T)%为56.5%,大于(G+C)43.5%。结合来自GenBank中的鲳科的中间低鳍鲳Peprilus medius和星斑真鲳Stromateus stellatus的相应同源序列,并以长鲳科的刺鲳Psenopsis anomala作为外群,构建系统进化树。结果显示,翎鲳和中国鲳亲缘关系较近,二者与银鲳亲缘关系较远,同为鲳科的鱼类聚类后再与作为外群的刺鲳相聚。系统进化树显示,银鲳为3种鲳属鱼类中较早分化出的种,刺鲳位于进化树的基部,是较鲳属鱼类更为原始的类群,与形态分析结果一致。

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