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海绵Pachychalina sp.体内细菌多样性的研究

文献类型: 中文期刊

作者: 方再光 1 ; 黄惠琴 1 ; 蔡海宝 1 ; 吕家森 1 ; 鲍时翔 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室

关键词: 海绵Pachychalina sp.;16SrDNA;细菌多样性

期刊名称: 微生物学报

ISSN: 1005-7021

年卷期: 2004 年 44 卷 04 期

页码: 427-430

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过非分离培养分析方法 ,直接从海绵体内提取细菌总DNA。以样品总DNA为模板进行PCR扩增获得细菌 1 6SrDNA。用 1 6SrDNA限制性酶切片段长度多态性 (ARDRA)和测序方法对南海湛江海域海绵Pachychalinasp .体内的细菌多样性进行了研究。在细菌 1 6SrDNA的ARDRA图谱中 ,大多数克隆的酶切带谱间存在差异 ;随机挑选2 2个克隆进行测序得到它们的 1 6SrDNA部分序列 ,大部分序列属于γ proteobacterium和α proteobacterium ,但有少数克隆序列与RDP数据库中收录的 1 6SrDNA序列间的相似性极小 ,不参与系统发育树的构建。研究结果表明海绵Pachychalinasp .体内细菌组成具有丰富的多样性。

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