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基于SLAF-BSA技术的蝴蝶兰花底色关联SNP分子标记开发与验证

文献类型： 中文期刊

作者： 肖文芳 1 ; 李佐 1 ; 陈和明 1 ; 吕复兵 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院环境园艺研究所/广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室

关键词： 蝴蝶兰;底色;SLAF-BSA;SNP

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 009 期

页码： 92-100

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选与蝴蝶兰花黄白底色相关的单核苷酸多态性（Single-nucleotide polymorphism,SNP）位点,以’黄金豹’蝴蝶兰（♀）和’白天使’蝴蝶兰（♂）及其杂交后代为实验材料,选择33个分布在5个不同颜色分布类型组群中的黄色底色杂交后代和仅有的2个纯黄色个体作为黄色底色群体,35个分布在对应5个颜色分布类型组群中的白色底色杂交后代作为白色底色群体,分别提取DNA并等量混合后构建2个不同底色DNA混池,采用特异位点扩增片段测序（SLAF-seq）结合BSA技术,对与花底色密切相关的候选标记进行鉴定。结果表明:共获得164 874个SLAF标签,其中含21 031个多态性SLAF标签,多态率为12.76%。SLAF标记在亲本中的平均序列深度为42×,在子代中的平均序列深度为46×。关联分析表明,在阈值>0.745 5时,筛选得到15个与花底色相关的SLAF候选标记,具27个SNP位点。采用SNaPshot测序技术在2个亲本、11个子代和4个不同的种质资源中验证SNP位点,筛选发现,Marker35886和Marker70907的2个SNP位点与相关SLAF序列中的SNP位点一致,对花底色的鉴定准确率分别为66.67%和73.33%,组合准确率达93.33%。本研究筛选到的2个SNP位点可作为有效的分子标记位点在蝴蝶兰育种早期进行辅助选择。

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