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羊草LVAP1基因的克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吕召志 1 ; 冯树丹 1 ; 于莹 1 ; 李蕊沁 1 ; 黎莉 1 ; 徐明华 1 ; 韩四平 1 ; 尹悦佳 1 ;

作者机构: 1.哈尔滨师范大学;吉林大学;吉林省农业科学院

关键词: LVAP1基因;克隆;生物信息学

期刊名称: 哈尔滨商业大学学报(自然科学版)

ISSN: 1672-0946

年卷期: 2010 年 06 期

页码: 15-20

摘要: 克隆羊草VHA-c基因并预测其编码蛋白质结构和功能.由羊草总RNA经RACE克隆获得VHA-c基因cDNA,采用生物信息学方法预测蛋白结构和功能.获得羊草VHA-c基因cDNA,命名为LVAP1基因(GenBank登录号为GQ397276),LVAP1基因开放阅读框为498 bp,编码165个氨基酸,有4个α-螺旋跨膜结构域,在第4个结构域上含有一个高度保守的G lu142残基,推测它是质子的结合位点.进化树分析显示,羊草LVAP1蛋白与小麦、碱蓬和冰叶日中花等植物的VHA-c蛋白具有高度的同源性,推测LVAP1亚基与其他VHA-c亚基执行相似的功能.

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