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基于棉花逆转座子的SSAP标记的开发

文献类型: 中文期刊

作者: 曹志斌 1 ; 杨郁文 1 ; 徐鹏 1 ; 张香桂 1 ; 张保龙 1 ; 倪万潮 1 ; 沈新莲 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院农业生物技术研究所

关键词: 棉花;逆转座子;多态性;SSAP

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2009 年 25 卷 06 期

页码: 1229-1233

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 从棉花BAC序列中鉴定了1个Ty1-copia类逆转座子,根据RNAseH-LTR连接区序列信息设计了特异引物,通过优化试验条件建立了一套经济、高效的SSAP(Sequence-specific amplification polymorphism)标记体系。分析棉属不同种的SSAP发现,SSAP在棉属不同种中均有丰富的扩增位点,而且棉花中SSAP多态性位点远高于AFLP(Fragment length polymorphic markers)。这一标记系统可增加棉花染色体端粒区域的标记密度,促进棉花高密度遗传图谱的构建。

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