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马铃薯PYL基因家族的全基因组鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 贾小霞 1 ; 齐恩芳 1 ; 马胜 1 ; 黄伟 1 ; 郑永伟 1 ; 白永杰 1 ; 文国宏 1 ;

作者机构: 1.甘肃省农业科学院马铃薯研究所/甘肃省马铃薯种质资源创新工程实验室

关键词: 马铃薯;PYL基因家族;脱落酸;基因表达分析

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2022 年 010 期

页码: 2533-2545

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 作为关键信号分子,脱落酸(ABA)通过其核心信号通路PYLs-PP2Cs-SnRK2s广泛调控植物的生长发育和逆境响应过程,PYLs蛋白作为ABA信号传导的核心组件,在ABA信号传导中发挥着不可替代的作用。为探究PYLs (PYR/PYL/RCARs)基因在马铃薯中的进化以及表达模式,本研究从马铃薯全基因组‘DM-v 6.1’共鉴定到17个StPYLs基因,并对其分布、蛋白理化性质、系统进化、基因结构特征以及基因表达模式进行了分析。结果表明,17个StPYLs基因不均匀分布在8条染色体上,其氨基酸大小在163~231aa之间,等电点在4.5~8.6之间,相对分子量在18.71~25.29 kD之间。根据基因结构和蛋白的系统发育特征, StPYL家族成员共分为3个亚组, motif 1存在于本家族所有基因中,说明它在StPYLs的进化过程中较为保守。基因表达模式分析表明,StPYL家族成员具有明显的组织表达特异性,且除StPYL1在外源激素(BAP、ABA和IAA)和非生物胁迫(高温、盐和干旱)下均上调表达外,其余基因存在功能分化,不同胁迫下的表达模式各异。本研究结果为进一步阐明StPYLs基因在马铃薯中的功能奠定了理论基础。

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