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青稞“昆仑12号”HVA1基因的克隆与蛋白质结构预测

文献类型： 中文期刊

作者： 姚晓华 1 ; 邓晓青 1 ; 吴昆仑 1 ; 张志斌 1 ;

作者机构： 1.青海省农林科学院/青稞遗传育种重点实验室/青海省高原作物种质资源创新与利用重点实验室

关键词： 青稞;HVA1基因;基因克隆;序列分析

期刊名称： 江西农业大学学报

ISSN： 1000-2286

年卷期： 2011 年 33 卷 05 期

页码： 26-31

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 抗旱性是青稞重要的耐逆性状。根据已报道的大麦抗旱相关基因HVA1的DNA序列,设计引物,以青稞品种昆仑12号经干旱处理8 h处理后的幼苗为材料,进行PCR扩增,得到约700 bp的HVA1基因编码框的全序列,将其克隆到pMD20-T上,重组子和酶切鉴定正确后,进行序列测定和分析。结果表明,与西藏强旱性青稞中HVA1基因相比较,昆仑12号与其核苷酸的同源性均达到99.5%,氨基酸的同源性达99.1%,其编码区全长642 bp,编码含213个氨基酸残基的蛋白质,富含Ala、Thr、Lys。该基因编码的蛋白质,包括9个重复的保守基元序列,属于第三组Lea蛋白。通过对HVA1基因编码蛋白的二级结构的分析表明,富含具有高度亲水性的α-螺旋结构,在植物细胞脱水时能够提供疏水区的亲水表面,可见青稞品种昆仑12号具有较强的抗旱性。抗旱相关基因的克隆为我国青藏高原青稞耐逆品种的选育奠定了基础。

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