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南阳牛BoLA-DRA基因编码区生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 楚秋霞 1 ; 陈付英 1 ; 王志方 1 ; 冯亚杰 1 ; 徐照学 1 ; 王荷香 2 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院畜牧兽医研究所

2.河南农业职业学院

关键词: 牛;主要组织相容性复合物;DRA;生物信息学

期刊名称: 中国牛业科学

ISSN: 1001-9111

年卷期: 2013 年 39 卷 06 期

页码: 32-35

摘要: [目的]预测南阳牛BoLA-DRA编码蛋白区的理化性质和结构特征。[方法]运用生物信息学分析软件。[结果]DRA基因与其它物种核苷酸序列的同源性均在90%以上。进化树分析羊与牛在同一个分支上,亲缘关系最近。BoLA-DRA编码蛋白为疏水性蛋白,1个跨膜螺旋的膜蛋白,7个功能结构域,6个翻译后修饰位点。预测N末端包含信号肽序列,其切割位点位于26~27位的氨基酸之间。亚细胞定位该蛋白定位在细胞膜上,由α螺旋结构,β折叠结构、β转角结构和无规则卷曲结构形成二级结构。[结论]本试验初步获得了BoLA-DRA编码蛋白区生物信息学分析数据。

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