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基于高通量测序的藜麦连作根际土壤微生物多样性研究

文献类型: 中文期刊

作者: 董艳辉 1 ; 于宇凤 1 ; 温鑫 1 ; 王亦学 1 ; 聂园军 1 ; 侯丽媛 1 ; 李亚莉 1 ; 刘江 1 ; 任元 1 ; 王育川 1 ; 曹秋芬 1 ; 吴慎杰 1 ; 王斌 1 ; 秦永军 1 ;

作者机构: 1.山西省农业科学院生物技术研究中心;农业部黄土高原作物基因资源与种质创新重点实验室;山西省农业科学院农业资源与经济研究所;山西省农业科学院农作物品种资源研究所;山西省农业科学院农业环境与资源研究所

关键词: 藜麦;连作;高通量测序;根际土壤;生物多样性

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2019 年 02 期

页码: 205-211

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了揭示连作藜麦土壤细菌群落结构和多样性的变化,采用高通量测序技术(Illumina-MiSeq)对不同处理(种植1 a、种植2 a)的连作藜麦根际土壤细菌进行16S rRNA基因V4区测序。结果表明,种植1 a较种植2 a的藜麦根际土壤细菌群落丰度和多样性指数都要高,其中,种植1 a较种植2 a的藜麦Chao1指数平均值增加16.4%,ACE指数平均值增加22.9%,Shannon指数平均值增加2.3%;菌群的分类学组成分析结果表明,重茬种植后,伦茨氏菌属、溶杆菌属、中慢生根瘤菌属、丛毛单菌属多样性增多;分枝杆菌属、藤黄单胞菌属、芽单胞菌属、浮霉状菌属等细菌多样性减少。功能预测分析表明,重茬种植后,编码细胞膜转运的功能基因、编码翻译、复制和修复的功能基因、编码外源性物质降解和代谢、多糖生物合成和代谢的功能基因大量减少,编码核苷酸代谢、萜类化合物的代谢、辅因子和维生素的代谢等功能基因少量减少;而编码信号转导和脂类代谢的功能基因有少量增加。

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