文献类型： 中文期刊
作者： 刘福利 1 ; 王飞久 1 ; 邵展茹 2 ;
作者机构： 1.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室
2.中国科学院海洋研究所
关键词： 长囊水云;叶绿体基因组;密码子使用偏性;最优密码子
期刊名称： 海洋科学进展
ISSN： 1671-6647
年卷期： 2012 年 30 卷 004 期
页码： 587-594
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 长囊水云(Ectocarpus siliculosus)是一种重要的海洋褐藻,是褐藻研究的模式生物.以其叶绿体全基因组序列为基础,对密码子使用特征进行分析.结果显示,叶绿体基因组的GC尤其是GC3值较低,分别为31.8%和17.32%,偏向使用以A或T碱基结尾的密码子;全基因组具有较小的有效密码子数(ENC)值和较高的密码子适应指数(CAI)值,表明其具有较高的同义密码子使用偏性;密码子使用特征受到基因表达水平上的自然选择以及基因碱基组成中性突变的双重影响,其中选择的作用对高表达基因密码子使用偏性的影响比较突出,而突变是低表达基因密码子使用偏性的主要影响因素.另外,首次确定UUU,GUU,UCA等12个密码子为长囊水云叶绿体基因组的最优密码子.
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