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葡萄生长素响应基因家族生物信息学鉴定和表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 袁华招 1 ; 赵密珍 1 ; 吴伟民 1 ; 于红梅 1 ; 钱亚明 1 ; 王壮伟 1 ; 王西成 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院园艺研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室

关键词: 葡萄;生长素响应基因家族;进化;果实发育

期刊名称: 遗传

ISSN: 0253-9772

年卷期: 2015 年 37 卷 07 期

页码: 720-730

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 生长素响应基因家族能调节植物体内生长素平衡和生长素信号途径。文章采用生物信息学方法检索获得葡萄(Vitisvinifera L.)基因组数据库中的生长素响应基因,通过分析其染色体定位、基因共线性和系统进化,发现葡萄基因组含有25个AUX_IAA基因、19个ARF基因、9个GH3基因、42个LBD基因。这些生长素响应基因不均匀分布在葡萄的19条染色体上,部分家族基因在染色体上形成基因簇。葡萄芯片数据结果表明,生长素响应基因在葡萄不同时期的果实和叶芽中均有表达,尤其在果实转色期、叶芽萌发或休眠期表达量急剧变化。研究结果为葡萄生长素响应基因在叶片和果实发育过程中的功能研究提供参考。

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