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4个H9N2亚型禽流感病毒毒株HA基因序列比较与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 于博 1 ; 章振华 2 ; 姜北宇 2 ; 钱爱东 1 ; 李林 2 ; 景小冬 2 ; 张建伟 2 ;

作者机构: 1.吉林农业大学动物科技学院

2.北京市农林科学院畜牧兽医研究所

关键词: 禽流感;H9N2;序列分析;血凝素基因

期刊名称: 安徽农业科学

ISSN: 0517-6611

年卷期: 2009 年 37 卷 31 期

页码: 15169-15171+15252

收录情况: 北大核心

摘要: [目的]测定H9N2 AIV4个毒株血凝素基因序列,并进行比较分析,从分子生物学角度了解各毒株间的差异和变异规律,进而了解该亚型禽流感的分布及流行规律。[方法]参照H9N2亚型禽流感HA基因序列设计1对引物,对禽流感A/Chicken/Hebei/WD/98(H9N2)、A/Chiken/Hebei/ZD/04(H9N2)、A/Chicken/Beijing/MY/06(H9N2)和A/Chicken/Beijing/PG/08(H9N2)4个毒株HA基因进行扩增、克隆和测序,并将这4个毒株的HA基因序列分别与GenBank登录的10个H9N2亚型禽流感毒株进行比较分析。[结果]获得了4个毒株HA基因(ORF)全长1 683 bp,编码561个氨基酸;4个毒株之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为92.5%~95.6%和95.2%~96.8%;WD株、MY株、PG株和ZD株与其他10个毒株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为82.6%~95.1%、83.0%~99.0%、82.7%~95.5%、81.30%~95.7%、86.6%~96.3%、86.6%~97.9%、87.0%~97.1%、86.9%~97.3。[结论]HA基因在不同毒株间具有很高的同源性。

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