文献类型： 中文期刊

作者： 周嘉 ¹ ; 王飞飞 ¹ ; 仲伟敏 ¹ ; 齐勇 ¹ ; 刘青 ¹ ; 史斌斌 ¹ ; 张晟 ¹ ; 牛歆雨 ² ; 郑乾明 ¹ ; 唐冬梅 ¹ ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院果树科学研究所

2.西藏大学农牧学院植物科学学院

关键词： 猕猴桃;基因组survey分析;基因组大小;系统进化

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2024 年 41 卷 011 期

页码： 2214-2223

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】全面了解多倍体猕猴桃种质资源的染色体倍性和基因组特征，并分析其在猕猴桃属植物中的系统进化关系，以期为多倍体猕猴桃全基因组组装提供参考。【方法】基于流式细胞术分析中华猕猴桃AcD2301(Actinidia chinensis)、软枣猕猴桃AcD2302(Actinidia arguta)、对萼猕猴桃AcD2303(Actinidia valvata)染色体倍性，利用Illumina二代测序平台开展基因组Survey分析，并基于SNP构建15种猕猴桃属植物系统进化树。【结果】中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303的染色体倍性分别为四倍体、四倍体、六倍体，与survey分析结果一致。Kmer分析预测中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303单套基因组大小分别约为626 Mb、668 Mb、585 Mb，杂合度为3.00%、3.30%、8.06%，重复序列比例为43.70%、45.30%、40.70%。系统进化树显示软枣猕猴桃与对萼猕猴桃亲缘关系较近，且均从中华猕猴桃独立进化而来。【结论】分析了中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303的染色体倍性、基因组大小和系统进化关系，为将来开展多倍体猕猴桃全基因组测序提供了参考，也为深入研究猕猴桃多倍化和系统进化提供了理论支持。