文献类型： 中文期刊
作者： 周瑶 1 ; 周恩强 1 ; 姚梦楠 1 ; 赵娜 1 ; 李宗迪 1 ; 朱宇翔 1 ; 王永强 1 ; 李波 1 ; 王学军 1 ; 缪亚梅 1 ; 汪凯华 1 ; 顾春燕 1 ; 魏利斌 1 ;
作者机构： 1.江苏沿江地区农业科学研究所经济作物研究室
关键词： 蚕豆;转录组;InDel;分子标记;遗传多样性
期刊名称： 江苏农业科学
ISSN： 1002-1302
年卷期： 2025 年 53 卷 008 期
页码： 35-41
收录情况： 北大核心
摘要： 我国是全球最大的蚕豆生产国，然而由于蚕豆基因组巨大(约为13.0 G),蚕豆基础研究进展缓慢。目前，受限于有限的蚕豆专用分子标记，我国蚕豆种质资源的评价和利用研究开展的不够深入。为了丰富蚕豆分子标记类型，充分有效评价和利用蚕豆种质资源，拟开展7份蚕豆材料的转录组测序，并对测序数据间存在的插入/缺失(InDel)位点进行特征分析。结果表明，成功挖掘出2 666个InDel位点，其中插入、缺失位点分别有841、1 825个，且单碱基的插入/缺失位点类型占比最大。此外，根据InDel位点信息，从插入/缺失碱基长度大于5 bp的序列中随机挑选25条序列进行InDel标记开发。利用开发的标记对国内141份蚕豆资源进行扩增，共筛选到有效InDel标记20对，多态性信息含量均值为0.32,平均每对标记中检测到2.85个等位基因，香农指数均值为0.62。聚类分析结果表明，江苏、浙江、湖北等省份的资源呈交叉分布，可能因为近年来各省份的蚕豆资源相互借鉴、利用，从而打破了地域限制，增加了彼此间的联系。基于转录组测序数据首次开发蚕豆InDel标记并成功将其应用于蚕豆种质资源的遗传多样性分析，不仅丰富了目前蚕豆的分子标记类型，而且对于今后蚕豆的基础研究和育种研究具有一定意义。
- 相关文献
[1]利用分子标记对‘淮稻5号’进行品种真实性鉴定. 顾伟航,田佳琪,朱明超,文正怀,严卫古,王兴龙,张大兵,袁政. 2018
[2]玉米功台皂性Insertjon/Deletion(InDel)分子标记的挖掘及其在杂交种纯度鉴定中的应用. 张体付,葛敏,韦玉才,赵涵. 2012
[3]基于InDel标记分析305份中国甘薯登记品种遗传多样性. 唐芬,赵路宽,苏一钧,肖世卓,袁蕊,翁宗宽,戴习彬,周志林,陈艳丽,曹清河. 2024
[4]南方90份秋播区蚕豆粒型性状的SSR关联分析. 刘金洋,周琰琰,林云,刘萌萌,薛晨晨,陈景斌,闫强,吴然然,陈新,袁星星. 2023
[5]石榴分子标记的研究进展. 刘兴满,葛金涛,吴秋月. 2015
[6]分子标记技术在杏鲍菇中的应用. 苏文英,杨和川,谭一罗,秦裕营,马腾,周振玲,浦汉春. 2017
[7]海滨雀稗EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发. 李华勇,王显生,王艳平,吴燕,沈奇,贾新平. 2016
[8]茉莉生殖发育与分子生物学特性研究分析. 邓衍明,齐香玉,苏家乐. 2019
[9]中国稻瘟病菌遗传多样性研究进展. 王伟舵,刘永锋. 2016
[10]玉米自交系的遗传多样性分析及杂种优势群划分. 林峰,梁帅强,周玲,赵涵. 2015
[11]水稻DUS测试标准品种的遗传多样性分析. 王艳平,沈奇,李华勇,张继红,王平,吴燕. 2012
[12]黄淮麦区小麦抗赤霉病品种(系)的鉴定和遗传分析. 张勇,杨子博,刘畅,杜莹莹,周羊梅,王安邦,顾正中. 2025
[13]Development of novel InDel markers and genetic diversity in Chenopodium quinoa through whole-genome re-sequencing. Zhang, Tifu,Lv, Yuanda,Zhou, Ling,Lu, Haiyan,Liang, Shuaiqiang,Bao, Huabin,Zhao, Han,Gu, Minfeng,Liu, Yuhe. 2017
[14]Genome re-sequencing of two accessions and fine mapping the locus of lobed leaflet margins in mungbean. Jiao, Keyuan,Guo, Wuxiu,Jiao, Keyuan,Li, Xin,Yuan, Xingxing,Yuan, Xingxing,Cui, Xiaoyan,Chen, Xin.
[15]Exploiting Illumina sequencing for the development of InDel markers in watermelon (Citrullus lanatus). Liu, G.,Xu, J. H.,Zhang, M.,Li, P. F.,Yao, X. F.,Hou, Q.,Zhu, L. L.,Ren, R. S.,Yang, X. P..
[16]甘薯IbANR基因的多态性分析. 武传建,戚骁,李仁赛,封功成,苏静静,葛海军,马代夫,王爱民. 2017
[17]8个水稻抗条纹叶枯病分子标记有效性的验证及评价. 张亚东,朱镇,陈涛,赵庆勇,周丽慧,于新,王才林. 2012
[18]糯玉米杂交种纯度InDel分子标记鉴定与田间鉴定的相关性分析. 胡俏强,陆海燕,李炯,陈舜权,吴月琴,戴惠学. 2016
[19]玉米InDel标记20重PCR检测体系的建立. 冯博,许理文,王凤格,薛宁宁,刘文彬,易红梅,田红丽,吕远大,赵涵,金石桥,张力科,蔚荣海,赵久然. 2017
[20]蚕豆立体种植模式及其效益分析. 吴春芳,姜永平,吴菊芳. 2006
作者其他论文 更多>>
-
基于种子发育转录组的豌豆bZIP基因家族分析及种子发育候选基因的鉴定
作者：周恩强;缪亚梅;周瑶;姚梦楠;赵娜;王永强;朱宇翔;薛冬;李宗迪;石宇欣;李波;汪凯华;顾春燕;王学军;魏利斌
关键词：豌豆;PastbZIP;基因家族;种子发育;进化分析;蛋白互作网络
-
大豆开花时间和成熟期性状全基因组关联分析与候选基因预测
作者：王琼;邹丹霞;陈兴运;张威;张红梅;刘晓庆;贾倩茹;魏利斌;崔晓艳;陈新;王学军;陈华涛
关键词：大豆;开花时间;成熟期;全基因组关联分析;SNP标记
-
86份大豆种质成熟期耐盐性评价
作者：姚梦楠;王永强;周恩强;周瑶;薛冬;汪凯华;魏利斌;赵娜;李波;缪亚梅;顾春燕;王学军
关键词：大豆;成熟期;耐盐性;种质资源;综合评价
-
淮南生态区大豆玉米带状复合种植模式下春大豆的品种筛选
作者：周瑶;周恩强;朱宇翔;姚梦楠;缪亚梅;李波;赵娜;魏利斌;王永强;王学军
关键词：大豆;带状复合种植;品种筛选;产量
-
团聚体粒径分布对土壤导热率的影响
作者：章建伟;颜栋;汪凯华;吴华山;徐聪;许仙菊;王学军;张永春;汪吉东
关键词：潮土;团聚体;导热率;含水率;有机质
-
环境因子对红螯螯虾影响的研究进展
作者：于鹏;张成硕;成钰;李波;马晶晶;管晓陈;王凯
关键词：红螯螯虾;环境因子;耐受性;生理机制
-
大豆叶型性状全基因组关联分析与候选基因鉴定
作者：王琼;朱宇翔;周密密;张威;张红梅;陈新;陈华涛;崔晓艳
关键词：大豆;叶型;异形叶;全基因组关联分析;SNP标记
