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基于转录组测序对紫花苜蓿铅胁迫相关基因的富集分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郭强 1 ; 王英哲 2 ; 王昆 3 ; 徐博 1 ;

作者机构: 1.吉林农业大学动物科学技术学院

2.吉林省农业科学院

3.黑龙江省二九一农场畜牧兽医科

关键词: 紫花苜蓿;转录组;铅胁迫;耐铅基因

期刊名称: 草业科学

ISSN: 1001-0629

年卷期: 2019 年 010 期

页码: 2525-2534

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本文采用高通量Illumina Hiseq测序平台对紫花苜蓿(Medicago sativa)的铅胁迫处理组(Pb96)和对照组(CK)进行转录组测序,并对测序数据进行分析,探究紫花苜蓿抗铅应答的分子机制.结果表明,在铅胁迫处理下共检测到2 242个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs).其中,1 321个DEGs上调表达,921个DEGs下调表达.GO (Gene ontology,http://www.geneontology.org/)富集分析,差异表达基因主要涉及物质代谢、蛋白结合、催化活性等.KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes,http://www.genome.jp/kegg/)分析,差异基因主要涉及代谢途径、光合作用、淀粉和蔗糖代谢等.COG (Clusters of orthologous groups of proteins/orthologous groups of genes)分析,差异基因主要涉及"碳水化合物的运输和新陈代谢"、"翻译、核糖体结构和生物发生"、"次生代谢产物的生物合成、转运和分解代谢"等.本研究通过对紫花苜蓿根系转录组分析,为研究紫花苜蓿耐铅分子机制提供参考.

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