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水稻垩白基因Chalk5功能标记的开发与应用

文献类型: 中文期刊

作者: 王晴晴 1 ; 王军 2 ; 范方军 2 ; 李文奇 2 ; 王芳权 2 ; 王绪鹏 3 ; 仲维功 2 ; 杨杰 2 ;

作者机构: 1.苏州农业职业技术学院

2.江苏省农业科学院粮食作物研究所

3.扬州大学生物科学与技术学院

关键词: 水稻;垩白;Chalk5;等位基因特异PCR;功能标记Q78

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2017 年 32 卷 01 期

页码: 1-8

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 水稻垩白是衡量水稻外观品质优劣的重要指标之一,降低稻米的垩白是培育优质水稻品种的前提。Chalk5是一个能显著降低稻米垩白从而提高稻米外观品质的主效基因。为提高垩白基因Chalk5在育种中的选择效率,在前人克隆的基础上,根据其启动子区域存在的2个功能突变位点,分别设计等位基因特异PCR(ARMS-PCR)引物,最终筛选出2对Chalk5基因的功能标记Chalk12、NChalk12和Chalk22、NChalk22,通过PCR产物测序的方法对这2对标记的检查结果进行了验证,说明Chalk12、NChalk12和Chalk22、NChalk22可以准确鉴定出Chalk5的不同基因型。利用该标记对不同来源的43份籼稻资源、江苏2007-2013年审定的65份粳稻品种和太湖流域179份粳稻地方资源进行了Chalk5基因型检测,筛选到携带chalk5低垩白率等位基因的籼稻资源20份,太湖流域粳稻地方资源仅8份,其余259份粳型资源中均不携带chalk5低垩白率等位基因,这也说明chalk5主要分布在籼型水稻资源中,在粳型资源中分布很少。

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