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利用Insertion/Deletion(InDel)分子标记检测玉米互交种混杂的原理及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 葛敏 1 ; 蒋璐 2 ; 张晓林 2 ; 赵涵 2 ; 张体付 2 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院农业生物技术研究所

2.江苏省农业科学院农业生物技术研究所,江苏省农业生物学重点实验室;南京农业大学

关键词: 插入/缺失;分子标记;正交;反交;纯度鉴定;玉米

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2013 年 11 卷 01 期

页码: 37-47

收录情况: CSCD

摘要: 尽管分子标记广泛用于玉米品种纯度鉴定,但由于互交种基因组具有相同的基因,现有的分子标记技术尚不能对互交种的混杂进行有效判定。本研究基于玉米互交种胚乳等位基因二倍剂量关系,利用Insertion/Deletion(InDel)标记在PCR指数扩增期对等位基因扩增相对量的观察值与理论值进行统计分析,通过概率对互交种进行判定。经过筛选,亲本B73、Mo17间存在共显性差异的8个InDel标记中,5个标记的PCR扩增质量满足互交种样本(正交种:B73×Mo17,反交种:Mo17×B73)的鉴定要求。这些标记以不同的循环数进行PCR扩增,发现37个循环是处于指数扩增期的最佳鉴定时期。同一标记在每个样本中以37个循环数进行3次扩增重复,统计分析发现:不同标记在杂交种叶片DNA中等位基因扩增相对量与理论比1的统计概率值从6.50E-08到1.000不等,证实标记在等位基因间的扩增效率并不完全一致。对互交种胚乳等位基因扩增相对量进行卡方测验,4个InDel标记能够对互交种样本进行准确区分,所得概率符合判定标准。标记110仅能准确判定正交种,对反交种样本的统计概率不满足反交种判定的概率标准。结果显示,该分子标记方法可成功用于玉米互交种的判定。

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