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烟草NtMLO家族全基因组序列鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张孝廉 1 ; 张吉顺 1 ; 余世洲 1 ; 余婧 1 ; 赵德刚 1 ;

作者机构： 1.贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院贵州省农业生物工程重点实验室山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室;贵州省烟草科学研究院烟草行业分子遗传重点实验室;西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室;贵州省农业科学院国家DUS中心贵阳分中心

关键词： 烟草;MLO蛋白;生物信息学;表达模式

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2019 年 11 期

页码： 1705-1720

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为系统鉴定普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组中白粉病感病基因NtMLO,通过构建已知拟南芥(Arabidopsis thaliana)和番茄(Solanum lycopersicum) MLO蛋白保守结构域的隐马尔可夫模型,获得烟草MLO家族候选序列共29个,对序列进行了基础理化性质、亚细胞定位和系统发育等分析。基础理化性质分析结果显示,NtMLO蛋白序列长度范围为479～605个氨基酸,理论等电点在7.02～9.50之间,富含碱性氨基酸,跨膜结构域数量为5～7个。亚细胞定位结果显示,该家族蛋白均定位于细胞膜上。通过对拟南芥、番茄、普通烟草、林烟草(N.sylvestris)和绒毛状烟草(N.tomentosiformis)等物种的共计90个MLO蛋白构建系统发育树,显示烟草中的MLO基因可分为5个亚组。通过定量PCR分析了不同亚组的19个NtMLO基因的组织表达特异性,发现除NtMLO3和NtMLO5两个基因在花中没有表达、NtMLO26在叶中没有表达外,其余NtMLO基因在根、茎、叶片和花组织中均有表达。本研究为全面了解烟草基因组中MLO基因提供相关信息。

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