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木薯MeNCED3基因克隆、结构变异及其表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 丁泽红 1 ; 付莉莉 1 ; 铁韦韦 1 ; 颜彦 1 ; 胡伟 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： 木薯;MeNCED3;克隆;结构变异;表达分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2016 年 32 卷 10 期

页码： 148-153

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在揭示木薯MeNCED3基因在干旱等非生物胁迫应答中的作用。用RT-PCR的方法从木薯叶片中克隆MeNCED3基因,用MEGA软件构建进化树;用Dna SP软件分析基因结构变异,用荧光定量PCR技术分析MeNCED3在不同非生物胁迫下的表达特性。结果显示,从木薯中克隆了一个NCED基因MeNCED3,该基因具有1 803 bp的开放阅读框,编码600个氨基酸,含有NCED家族保守结构域。进化树分析表明,MeNCED3与杨树和杞柳中同源基因的亲缘关系较近,序列相似性分别达到83.9%和82.5%。基因结构变异发现,木薯野生种和栽培种之间共有8个错义突变,其中5个可能与MeNCED3的表达量有关。实时荧光定量PCR分析表明,MeNCED3在根中的表达量要远远高于叶片和茎。而且,MeNCED3的表达能被PEG、ABA和NaCl处理显著诱导。因此,MeNCED3在转录水平对木薯渗透胁迫、盐胁迫起调控作用,可作为候选基因进一步研究其在木薯抗旱中的功能。

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