文献类型： 中文期刊

作者： 毛雪琴 ¹ ; 姜华 ¹ ; 王艳丽 ¹ ; 张震 ¹ ; 柴荣耀 ¹ ; 王教瑜 ¹ ; 邱海萍 ¹ ; 杜新法 ¹ ; 孙国昌 ¹ ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院

关键词： 稻瘟病;稻瘟病菌;基因组;图位克隆;无毒基因

期刊名称： 中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2013 年 27 卷 04 期

页码： 425-433

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了明确稻瘟病菌不同拼接版本基因组序列的差异,促进合理利用不同拼接版本基因组序列,比较了不同版本稻瘟病菌基因组数据库微卫星序列的分布情况,功能基因的位置及长度差异,SSR引物的位置差异等。结果表明,不同基因组数据库在序列长度上差异明显,功能基因的位置、SSR引物位置和SSR核苷酸重复类型数量也差异明显。无毒基因Avr-Pizt连锁标记比较分析表明Avr-Pizt基因定位在不同数据库中差别明显。不同稻瘟病菌数据库中,第7染色体的序列与其上的BAC序列之间差异显著,虽然这不影响功能基因的分析,但影响无毒基因图位克隆的定位区间的判断。因此,稻瘟病菌研究者应根据实际情况选择相应的数据库。