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大豆R6期籽粒氨基酸含量的全基因组关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张红梅 1 ; 熊雅文 2 ; 许文静 3 ; 张威 1 ; 王琼 1 ; 刘晓庆 1 ; 刘慧 3 ; 崔晓艳 1 ; 陈新 1 ; 陈华涛 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院经济作物研究所

2.南京农业大学生命科学学院

3.南京农业大学园艺学院

关键词: 大豆;R6期;籽粒;氨基酸含量;全基因组关联分析;候选基因

期刊名称: 作物学报

ISSN:

年卷期: 2023 年 012 期

页码: 3277-3288

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为解析大豆R6期籽粒氨基酸含量的遗传机制,本研究利用264份大豆种质资源材料在2020年和2021年测定了与菜用大豆食味品质相关的精氨酸、丙氨酸、谷氨酸和天冬氨酸含量,并进行全基因组关联分析(GWAS)。结果表明, 2年共检测到89个与大豆R6期籽粒4种氨基酸含量显著关联的SNP位点,其中有5个标记能同时被2年或2个性状重复检测到,分别为S03_40647948 (Chr.3)、S05_2727464 (Chr.5)、S10_4122977 (Chr.10)、S17_34559022 (Chr.17)和S19_48541685 (Chr.19),单个位点可以解释11.25%~28.19%的表型变异解,其中Chr.17上的标记S17_34559022在2020年和2021年被共同检测到与谷氨酸含量显著关联,属稳定遗传的位点。共挖掘出9个候选基因,其中ZIP蛋白(zinc finger family protein)、转录因子bHLH(bHLHDNA-binding superfamily protein)、生长素反应蛋白家族(auxin-responsive protein family)和天冬氨酸蛋白酶家族蛋白(aspartyl protease family protein),可能是影响菜用大豆氨基酸代谢的重要基因。本研究挖掘到的5个氨基酸含量主效SNP位点和9个候选基因,有助于解析大豆R6期籽粒氨基酸含量的遗传基础及其调控机制,为菜用大豆食味品质遗传改良奠定了基础。

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