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香蕉MaARF19-1基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄东梅 1 ; 许奕 1 ; 李敬阳 1 ; 林妃 1 ; 李艳霞 1 ; 李羽佳 1 ; 魏卿 1 ; 宋顺 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院海口实验站海南省香蕉遗传改良重点实验室

关键词： 香蕉;生长素响应因子;ARF;克隆;序列分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2018 年 37 卷 10 期

页码： 4391-4397

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用PCR方法从香蕉中克隆了一个生长素响应因子基因,命名MaARF19-1,并对其进行序列分析。结果表明,该基因全长3 411 bp,编码1 136个氨基酸,分子量为126 578.50 u,理论等电点pI为6.26;MaARF19-1蛋白的氨基酸组成中,Gln占比13.12%为最高,Trp占比1.06%为最低,其亲水性氨基酸均匀分布在整个肽链中,多于疏水性氨基酸;通过Motif Search工具发现了B3、Auxin_resp、AUX_IAA family3个结构域,序列观察还发现一段Q-富集区,表明该蛋白为具有转录激活功能的生长素响应因子;多序列比对和进化树分析表明,MaARF19-1编码的蛋白与其他植物中ARF19编码的蛋白具有较高的一致性。

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