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基于叶绿体DNA accD-psaI序列分析的广西梨地方品种遗传多样性研究

文献类型： 中文期刊

作者： 齐丹 1 ; 曹玉芬 2 ; 胡红菊; 王超; 常耀军; 田路明; 董星光; 张莹; 霍宏亮; 徐家玉; 刘超; 詹俊宇;

作者机构： 1.中国农业科学院果树研究所/农业部园艺作物种质资源利用重点实验室

2.湖北省农业科学院果树茶叶研究所

关键词： 梨;地方品种;叶绿体DNA;遗传多样性;广西

期刊名称： 中国南方果树

ISSN： 1007-1431

年卷期： 2019 年 3 期

页码： 91-93,98

摘要： 为评价广西梨地方品种的遗传多样性水平,对54份广西梨地方品种的叶绿体DNA高变区域accD-psaI进行测序,并与Genbank中42份梨主栽品种(来自白梨、秋子梨、砂梨、新疆梨、西洋梨和选育品种)的accD-psaI序列做比较.对比发现,广西梨地方品种的accD-psaI序列长度为683~936 bp不等,检测出单倍型(H1~H6)数量6个,简约性信息位点1个,单一突变位点5个,插入/缺失(InDels)片段5个,单倍型多样性(Hd)为0.710,核苷酸多样性(Pi)为0.64*10-3.单倍型H1、H2和H3为常见单倍型,其中H1在广西各地分布最为广泛.Median-joining Network图显示,单倍型H4和H5为原始单倍型,H2、H3和H8为较进化单倍型.2个原始单倍型只在横县梨地方品种中检测到,同时横县的单倍型类型最多,推测横县为广西梨起源与多样性中心.

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