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大白菜WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 蒋明 1 ; 苗立祥 2 ; 张豫超 2 ; 管铭 1 ; 潘小翠 1 ;

作者机构： 1.台州学院生命科学学院

2.浙江省农业科学院园艺研究所

关键词： 大白菜;WRKY转录因子;全基因组;序列分析

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2013 年 25 卷 05 期

页码： 980-986

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WRKY转录因子是一类重要的调控分子,在高等植物中以基因家族的形式存在。试验以大白菜基因组数据为材料,利用生物信息学手段对WRKY转录因子进行了全基因组鉴定与分析。结果表明,大白菜至少有134个WRKY转录因子,蛋白序列长度为143~1 082;基因组DNA全长880~9 099 bp,具1~15个内含子。染色体定位结果表明,10条染色体上均有WRKY转录因子基因的分布,A3染色体上最多(26),A10染色体分布最少(4)。大白菜WRKY转录因子可分为3大类,Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为27,83和24,它们处于进化树的不同分支。除保守的WRKYGQK和常见变异序列WRKYGKK外,新发现WRKDGQK,WRKNGQK和WMKYGQK等3种WRKY结构域类型。

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