文献类型： 中文期刊
作者： 姜涛 1 ; 温春秀 1 ; 田伟 1 ; 谢晓亮 1 ; 卢瑞克 1 ; 温赛群 1 ; 刘灵娣 1 ;
作者机构： 1.河北省农林科学院经济作物研究所河北省药用植物技术创新中心
关键词： 连翘（Forsythia suspensa （Thunb.） Vahl）;SNP;SLAF-seq技术;分子标记
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2021 年 016 期
页码： 5405-5413
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 连翘（Forsythia suspensa （Thunb.） Vahl）是一种极具开发价值的药用植物,本研究利用特异性位点扩增片段测序技术对39份连翘种质资源进行了分子标记开发,通过测序共获得112.28 Mb reads数据,各样本reads数据在1 324 860～5 911 565之间,样本平均测序质量值Q30为96.29%;平均GC含量为36.97%。通过生物信息学分析,本研究获得535 357个SLAF标签,样本的平均测序深度为16.20倍,其中多态性的SLAF标签共有262 297个,开发获得1 809 741个SNP标记。利用开发的SNP分子标记将39份连翘种质资源分为4组,连翘SNP分子标记的研究可为连翘种质资源鉴定和遗传多样性分析提供理论基础。
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