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用于荔枝qPCR分析的内参基因克隆及稳定性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 魏永赞 1 ; 赖彪 1 ; 胡福初 1 ; 李晓静 1 ; 胡桂兵 1 ; 王惠聪 1 ;

作者机构： 1.华南农业大学园艺学院

关键词： 荔枝;qPCR;内参基因;克隆;稳定性分析

期刊名称： 华南农业大学学报

ISSN： 1001-411X

年卷期： 2012 年 33 卷 03 期

页码： 301-306

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用基因克隆和测序,从‘妃子笑’荔枝果皮中获得了β-Actin、GAPDH和18S rRNA 3个qPCR分析常用的内参基因全长序列,其长度分别为1 273、1 368和1 712 bp;3个基因与其他物种高度同源,氨基酸序列相似性均超过了98%.在此基础上,结合已报道的UBQ、eEF和25S rRNA 3个常用的内参基因,对β-Actin、GAPDH、18S rRNA,UBQ、eEF和25S rRNA 6个常用内参基因在荔枝果实发育不同阶段和外源生长调节剂处理后表达稳定性进行了分析,同时比较了geNorm、Norm Finder和BestKeeper 3种不同算法的差异.结果表明:以上6个基因中,β-Actin基因在3种不同算法下均保持了较好的表达稳定性.

  • 相关文献

[1]用于荔枝qPCR分析的内参基因克隆及稳定性分析. 魏永赞,赖彪,胡福初,李晓静,胡桂兵,王惠聪. 2011

[2]利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行内参基因稳定性分析的方法. 吴建阳,何冰,杜玉洁,李伟才,魏永赞. 2017

[3]澳洲坚果实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选. 杨倩,杨子平,周娅丽,陈东泉,刘恒. 2020

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