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橡胶树魏克汉种质群体结构分析

文献类型： 中文期刊

作者： 方家林 1 ; 龙青姨 2 ; 华玉伟 1 ; 黄华孙 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所

2.云南省热带作物科学研究所

关键词： 橡胶树;魏克汉种质;EST-SSRs;群体结构;关联分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2013 年 32 卷 05 期

页码： 72-77

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 群体结构是引起关联分析假阳性的最主要因素。本研究基于25个EST-SSRs位点,分析了283份橡胶树魏克汉种质群体的哈迪-温伯格平衡和群体分层情况。结果表明,在被检查的25个位点中13个位点偏离哈迪-温伯格平衡;在共祖系数为50%、60%、70%和80%时,283份种质中具有明确亚群归属的分别只有155份、110份、61份和22份,分别占总种质的54.78%、38.87%、21.55%和7.78%。同时,25个多态位点共形成了300个位点组合,20个位点组合(6.67%)呈显著的连锁不平衡状态,其中5个位点组合(1.67%)达到极显著连锁不平衡。由上可知283份橡胶树魏克汉种质所构成的群体具有一定的群体分层,但分化程度较小,可用于关联分析。

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