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水稻(Oryzasativa L.)潜在内源性致敏原的生物信息学筛选与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 朱方超 1 ; 贾瑞宗 2 ; 徐林 3 ; 郭运玲 3 ; 孔华 3 ;

作者机构： 1.海南大学农学院

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室

3.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： 水稻;致敏原;保守结构域;交叉反应性

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2015 年 34 卷 06 期

页码： 1306-1318

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 食物中的蛋白质是最常见的食入性致敏原。为了对水稻中的内源性致敏原有一个全面的认识和了解,本研究利用全序列比对的方法比较了水稻蛋白与已知致敏原之间的序列相似性,获得了水稻潜在致敏原,并对其保守结构域、分子功能、系统发育和染色体分布进行了分析和描述。结果一共发现了122个水稻潜在致敏蛋白,其中包括了22个已被数据库收录的水稻致敏原;保守结构域分析显示它们分别属于37个蛋白家族,其中的HATPase_c_3(Histidine kinase-,DNA gyrase B-,and HSP90-like ATPase,PF13589)结构域未在已知致敏原中发现;系统发育分析则分别揭示了水稻Prolamin蛋白超家族和Dna K蛋白家族的多样性;而且潜在致敏蛋白在水稻染色体上有成簇状分布的趋势。

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