文献类型： 中文期刊

作者： 胡伟 ¹ ; 许巧情 ¹ ; 郭慧芝 ¹ ; 李由申 ¹ ; 韩盼盼 ¹ ; 袁汉文 ¹ ; 张书环 ¹ ; 陈敦学 ¹ ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院长江水产研究所/农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室;长江大学动物科学学院;贵州大学动物科学学院

关键词： 达氏鲟;自噬;微管相关蛋白1A/1B轻链3B(MAP1LC3B);GABARAP泛素结构域;抗病机制

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 445-452

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】掌握达氏鲟微管相关蛋白1A/1B轻链3B基因(MAP1LC3B)的表达模式,为后续研究MAP1LC3B基因功能及揭示达氏鲟的抗病分子机制提供理论依据。【方法】采用RACE技术从达氏鲟组织中克隆MAP1LC3B基因,通过ProtParam、TMpred、Phyre2及Singal 4.1等在线软件进行生物信息学分析,同时借助实时荧光定量PCR检测MAP1LC3B基因在达氏鲟不同组织中的表达情况。【结果】达氏鲟MAP1LC3B基因cDNA序列全长2208 bp,包含378bp的开放阅读框(ORF)、202 bp的5'端非编码区(5'-UTR)和1628 bp的3'端非编码区(3'-UTR),编码125个氨基酸。MAP1LC3B氨基酸序列含有GABARAP泛素结构域、Agt7结合位点、脂化位点和维管束蛋白结合位点。达氏鲟MAP1LC3B蛋白由18种氨基酸组成,其中谷氨酸(Glu)含量最高(占9.6%)、丙氨酸(Ala)含量最低(占1.6%);蛋白分子量为14743.01 Da,理论等电点(pI)为8.92,不稳定系数为65.12,总平均亲水性为-0.484,是一种不稳定的疏水性蛋白,且不存在跨膜结构,也无信号肽序列。MAP1LC3B基因在达氏鲟鳃、脑、皮肤、头肾、前肾、脾脏、中肾、心脏和肠道等组织中均有表达,以在鳃和肠道组织中的相对表达量较高,显著高于在其他组织中的相对表达量(P<0.05)。【结论】达氏鲟MAP1LC3B基因具有较高的保守性,在鳃和肠道黏膜免疫组织中高表达,表明自噬参与达氏鲟黏膜免疫过程,调节机体免疫反应。