文献类型： 中文期刊
作者： 高建明 1 ; 杨峰 1 ; 郑金龙 2 ; 刘巧莲 1 ; 陈河龙 1 ; 易克贤 2 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所
2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
关键词： 烟草疫霉;侵染;剑麻;转录组
期刊名称： 热带作物学报
ISSN： 1000-2561
年卷期： 2014 年 35 卷 03 期
页码： 163-169
收录情况： CSCD
摘要： 为克隆剑麻受斑马纹病病原菌烟草疫霉侵染后的应答基因,以病原菌侵染前后的剑麻H.11648叶片为材料,构建剑麻转录组Unigene数据库;组装得到非冗余Unigene 131 422个,其中,500~1 000 bp的Unigene占总数65.39%,Unigene的数量随其长度递减。GO分类分析发现:在得到的所有Unigene中,注释到生物过程的基因最多(152 835);细胞组分其次(129 197);参与分子功能的最少(47 420)。KEGG代谢通路分析将剑麻转录组unigene分成128类,其中,参与生化代谢通路的Unigene最多,有9 354个,占总数27.09%;参与植物-病原互作代谢通路的基因有1 795个,占总数5.2%。基因表达丰度RPKM值显示上调基因9 415个,下调基因28 980个,其中参与病原互作的基因占680个。
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