文献类型： 中文期刊
作者： 安泽伟 1 ; 赵彦宏 2 ; 程汉 1 ; 李维国 1 ; 黄华孙 1 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所
2.鲁东大学生命科学院
关键词： 橡胶树;SSR;EST
期刊名称： 遗传
ISSN： 0253-9772
年卷期： 2009 年 31 卷 03 期
页码： 311-319
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 通过对橡胶树10778条EST序列进行拼接,共得到Unigene3090条,从中发掘出分布于353条Unigene的430个EST-SSR位点,SSR发生频率为11.42%,平均分布距离为3.93kb。在橡胶树EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占63.49%、32.09%。TC/AG、CT/GA和CTT/GAA、AAG/TTC、AGA/TCT是二、三核苷酸的优势重复类型。利用PRIMER5.0设计引物148对,随机挑选21对引物进行合成,并用其中15对扩增较好的引物,通过变性聚丙烯酰胺凝胶结合银染的方法对44个橡胶树无性系进行了遗传多样性检测,构建了聚类分析树状图。研究结果表明,从橡胶树EST中开发SSR标记是有效、可行的,文章所开发的EST-SSR引物可用于橡胶树遗传分析研究。
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