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江苏省和东北地区杂草稻落粒性基因的序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王军 1 ; 徐详 2 ; 杨杰 1 ; 王芳权 3 ; 范方军 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院粮食作物研究所

2.国家水稻改良中心南京分中心

3.江苏省农业科学院粮食作物研究所/国家水稻改良中心南京分中心

关键词： 杂草稻;落粒性;qSH1;SH4;序列分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2014 年 12 卷 06 期

页码： 1097-1102

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 杂草稻是指在稻田中和稻田周边生长的具有杂草特性的半野生稻,中国大部分稻区都受到了杂草稻不同程度的危害,其中,以江苏省和东北地区危害最为严重。为了探明江苏省和东北地区杂草稻落粒性的基因型,为研究杂草稻的落粒性提供依据,本研究根据已经报道的水稻落粒性基因q SH1、SH4的功能区设计引物,对来源于江苏省、黑龙江省、吉林省和辽宁省的33份落粒性强的杂草稻进行PCR扩增,通过测序分别得到2个片段长度约500 bp、600 bp的功能区核苷酸碱基序列。将获得的序列与Gen Bank中序列进行比对分析,结果表明:33份杂草稻与水稻在q SH1功能区存在1个碱基位点变异,经证实为前人报道的SNP位点,另外有3份杂草稻在q SH1功能区下游存在1个位点碱基变异,但不能确定是否为一个新的功能区;33份杂草稻与水稻在SH4功能区序列完全一致。研究结果说明江苏省和东北地区杂草稻的落粒性是由q SH1控制的,与SH4无关。

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