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辣椒组蛋白去乙酰化基因家族分离鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李涛 1 ; 徐小万 1 ; 黎振兴 1 ; 王恒明 1 ; 李植良 1 ; 李颖 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院蔬菜研究所

关键词： 辣椒;组蛋白去乙酰化;生物信息学分析;基因表达

期刊名称： 辣椒杂志

ISSN： 1672-4542

年卷期： 2015 年 13 卷 01 期

页码： 1-7

摘要： 组蛋白去乙酰化在基因表达调控方面扮演重要角色,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。在基因组范围内,利用生物信息学方法对辣椒的组蛋白去乙酰化(HDAC)基因家族的各成员、分布及结构和功能等进行分析。预测结果显示辣椒HDAC家族包含14个蛋白质,分为3个亚族,其中RPD3/HDA1成员最多,为10个;HD2具有3个成员,SRT2仅有1个成员;其主要分布在8个染色体上,且进化分析结果表明辣椒HDAC基因成员与拟南芥家族具有相似分类。在辣椒HDAC结构域中包含18个重要的基序,同组中的HDAC成员蛋白序列的氨基酸保守结构域基本一致,且各亚族成员的氨基酸保守结构域组成特异,表明这些基序的存在对HDAC蛋白功能的执行是必需的。分析辣椒发育过程中HDAC各成员表达谱数据发现,Ca HDA1在果皮和胎座成熟过程中表达量逐渐升高,说明该基因可能参与了辣椒后期果实的发育过程。这将为辣椒HDAC家族基因的深入研究和功能解析提供实验参考依据。

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